文化団体連盟本部（文連本部）は、学内の生徒会のような位置づけにある「全塾協議会」という組織の一執行機関として活動しています。文連本部は学内の文化系サークルによって組織され、各団体の支援および管理を行っています。具体的な業務として、全塾協議会から交付された交付金を文連加盟団体に活動予算として分配することや、三田キャンパスにある学生団体ルームの管理などが挙げられます。文連本部はその業務により部門を分けており、加盟団体の財務体制の監査・交付金分配額の決定を行う「監査」、決算書類作成や予算の策定・申請を行う「財務」、学生団体ルームの管理を行う「三田部室」、文連公演祭の企画・準備、OBOGとの連絡を担当する「三田会」、文連総会の実施を担当する「総会」、広報活動を担当する「広報」に分けられます。